Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCORQ96JN0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LCORQ96JN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms