Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC16BQ96JE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC16BQ96JE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms