Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAX2Q96IS3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAX2Q96IS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAX2Q96IS3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms