Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN37Q96GY3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN37Q96GY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms