Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCD1Q96GM5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms