Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT43Q96FT9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT43Q96FT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms