Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE2Q96DL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NXPE2Q96DL1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXPE2Q96DL1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms