Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ULK4Q96C45 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms