Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43Q96BQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM43Q96BQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM43Q96BQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms