Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN23Q96B33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN23Q96B33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN23Q96B33 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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