Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74AQ96AQ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74AQ96AQ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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