Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB7BQ96AH8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB7BQ96AH8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB7BQ96AH8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms