Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP1MTQ969P6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP1MTQ969P6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms