Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEAL3Q969E4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEAL3Q969E4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms