Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A3Q93084 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2A3Q93084 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A3Q93084 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms