Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIFAP3Q92845 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIFAP3Q92845 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KIFAP3Q92845 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KIFAP3Q92845 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIFAP3Q92845 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIFAP3Q92845 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms