Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A3Q92570 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A3Q92570 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms