Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD6Q92537 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD6Q92537 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD6Q92537 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD6Q92537 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD6Q92537 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD6Q92537 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD6Q92537 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms