Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPDL3AQ92484 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPDL3AQ92484 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPDL3AQ92484 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms