Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCN9Q8WX39 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN9Q8WX39 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN9Q8WX39 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN9Q8WX39 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN9Q8WX39 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN9Q8WX39 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms