Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
DDX54Q8TDD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DDX54Q8TDD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX54Q8TDD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms