Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAG3L4Q8TBR4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAG3L4Q8TBR4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAG3L4Q8TBR4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms