Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX2-3Q8TAU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NKX2-3Q8TAU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NKX2-3Q8TAU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX2-3Q8TAU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms