Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATJQ8NI35 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATJQ8NI35 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms