Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA1Q8NG27 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA1Q8NG27 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms