Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF397Q8NF99 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF397Q8NF99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms