Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC9Q8NEP7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC9Q8NEP7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC9Q8NEP7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms