Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM2

SHCBP1, SHC SH2 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1Q8NEM2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHCBP1Q8NEM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHCBP1Q8NEM2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms