Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK4Q8NE63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK4Q8NE63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms