Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HJURPQ8NCD3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HJURPQ8NCD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms