Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71DQ8N9W8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71DQ8N9W8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms