Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMER3Q8N944 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMER3Q8N944 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms