Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD13CQ8N6S4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD13CQ8N6S4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ANKRD13CQ8N6S4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD13CQ8N6S4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms