Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5S9

CAMKK1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK1Q8N5S9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMKK1Q8N5S9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKK1Q8N5S9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK1Q8N5S9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK1Q8N5S9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK1Q8N5S9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK1Q8N5S9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK1Q8N5S9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK1Q8N5S9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK1Q8N5S9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK1Q8N5S9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms