Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM20Q8N5G0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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