Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NME8Q8N427 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NME8Q8N427 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms