Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EID3Q8N140 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EID3Q8N140 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms