Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SPICE1Q8N0Z3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPICE1Q8N0Z3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPICE1Q8N0Z3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPICE1Q8N0Z3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms