Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP3Q8IZU3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP3Q8IZU3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP3Q8IZU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms