Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM48Q8IWZ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms