Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC103Q8IW40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms