Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APLFQ8IW19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APLFQ8IW19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms