Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC71Q8IV32 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms