Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNL1Q8IU54 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFNL1Q8IU54 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms