Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRAPQ7Z569 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRAPQ7Z569 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAPQ7Z569 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms