Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT25Q7Z3Z0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT25Q7Z3Z0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT25Q7Z3Z0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms