Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2AQ7L0J3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2AQ7L0J3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SV2AQ7L0J3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms