Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CD109Q6YHK3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CD109Q6YHK3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
CD109Q6YHK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CD109Q6YHK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms