Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00114Q6XXX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00114Q6XXX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 766.2 ms