Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRAIDQ6UW56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms